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  • 基于机器学习的生长激素结合蛋白识别方法研究

    Author(s):

    范仕豪

    Publication Title:

    Wen Yuan (Primary School Edition) 2021 No.11

    Affiliations:

    西北农林科技大学水利与建筑工程学院

    Abstract:

    生长激素结合蛋白对人体内的生长激素水平调节有着重要作用,传统主要通过生化实验来鉴定和表征方法鉴定生长激素结合蛋白,该实验耗时耗力,且花费巨大。因此,本研究拟在收集生长激素结合蛋白数据的基础上,建立机器学习模型,实现生长激素结合蛋白的计算识别。在特征提取过程中,实现了TF-IDF和One-hot等特征提取方法,并从中筛选了20个关键特征,在此基础上,分别构建决策树、梯度提升树及随机森林等三种预测模型。通过比较三种预测模型的评价指标,得出构建的梯度提升树预测模型性能最好,precision为0.82,recall为0.81,f1-score为0.80,accuracy为0.81。

    Keywords:

    生长激素结合蛋白;机器学习;识别预测;TF-IDF;One-Hot;PCA;网格搜索;决策

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